MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 4650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
2	NC_019967	GAG	2	6	533	538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
3	NC_019967	GAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
4	NC_019967	GAG	2	6	554	559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
5	NC_019967	CGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
6	NC_019967	AAC	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
7	NC_019967	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
8	NC_019967	CTG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
9	NC_019967	CAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
10	NC_019967	AAC	3	9	953	961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
11	NC_019967	CTCGA	2	10	962	971	20 %	20 %	20 %	40 %	433593319
12	NC_019967	AC	3	6	1041	1046	50 %	0 %	0 %	50 %	433593319
13	NC_019967	ATG	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593319
14	NC_019967	AATCGC	2	12	1120	1131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593319
15	NC_019967	GT	3	6	1152	1157	0 %	50 %	50 %	0 %	433593319
16	NC_019967	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
17	NC_019967	CCT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593319
18	NC_019967	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
19	NC_019967	GGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
20	NC_019967	GAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
21	NC_019967	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
22	NC_019967	CTCG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	25 %	50 %	433593319
23	NC_019967	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
24	NC_019967	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
25	NC_019967	CGTTC	2	10	1579	1588	0 %	40 %	20 %	40 %	433593319
26	NC_019967	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
27	NC_019967	CTG	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
28	NC_019967	CTC	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593320
29	NC_019967	TCG	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
30	NC_019967	TC	3	6	2414	2419	0 %	50 %	0 %	50 %	433593320
31	NC_019967	AGC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
32	NC_019967	GTTC	2	8	2483	2490	0 %	50 %	25 %	25 %	433593320
33	NC_019967	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
34	NC_019967	ACG	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
35	NC_019967	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593320
36	NC_019967	GTGG	2	8	2839	2846	0 %	25 %	75 %	0 %	433593320
37	NC_019967	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593320
38	NC_019967	CAC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
39	NC_019967	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
40	NC_019967	GGCTTT	2	12	3111	3122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433593320
41	NC_019967	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
42	NC_019967	CAC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
43	NC_019967	TC	3	6	3203	3208	0 %	50 %	0 %	50 %	433593320
44	NC_019967	AG	3	6	3211	3216	50 %	0 %	50 %	0 %	433593320
45	NC_019967	TGA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593320
46	NC_019967	CGG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
47	NC_019967	CGG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
48	NC_019967	TCG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
49	NC_019967	CTCACT	2	12	3502	3513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	433593321
50	NC_019967	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
51	NC_019967	CGT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
52	NC_019967	TCC	3	9	3614	3622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
53	NC_019967	CGAT	2	8	3686	3693	25 %	25 %	25 %	25 %	433593321
54	NC_019967	CCT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
55	NC_019967	CGT	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
56	NC_019967	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593321
57	NC_019967	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
58	NC_019967	CAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
59	NC_019967	CTGT	2	8	3995	4002	0 %	50 %	25 %	25 %	433593321
60	NC_019967	TCG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
61	NC_019967	GT	3	6	4030	4035	0 %	50 %	50 %	0 %	433593321
62	NC_019967	GAT	3	9	4243	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593321
63	NC_019967	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593321
64	NC_019967	TTGA	2	8	4674	4681	25 %	50 %	25 %	0 %	433593322
65	NC_019967	TCG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
66	NC_019967	CAGC	2	8	4733	4740	25 %	0 %	25 %	50 %	433593322
67	NC_019967	GCG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
68	NC_019967	TCG	3	9	4831	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
69	NC_019967	GTC	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
70	NC_019967	GGC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
71	NC_019967	CGCT	2	8	5064	5071	0 %	25 %	25 %	50 %	433593322
72	NC_019967	GTC	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
73	NC_019967	CGGT	2	8	5116	5123	0 %	25 %	50 %	25 %	433593322
74	NC_019967	CAGCG	2	10	5136	5145	20 %	0 %	40 %	40 %	433593322
75	NC_019967	CTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
76	NC_019967	GCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593323
77	NC_019967	AGCG	2	8	5680	5687	25 %	0 %	50 %	25 %	433593323
78	NC_019967	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
79	NC_019967	GACG	2	8	5799	5806	25 %	0 %	50 %	25 %	433593323
80	NC_019967	GTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
81	NC_019967	GTGGGT	2	12	5821	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
82	NC_019967	GCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
83	NC_019967	GGCT	2	8	5969	5976	0 %	25 %	50 %	25 %	433593323
84	NC_019967	CGT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
85	NC_019967	CCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593323
86	NC_019967	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593323
87	NC_019967	AAC	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593323
88	NC_019967	TC	3	6	6208	6213	0 %	50 %	0 %	50 %	433593323
89	NC_019967	CTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
90	NC_019967	CA	3	6	6281	6286	50 %	0 %	0 %	50 %	433593323
91	NC_019967	TTC	3	9	6455	6463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
92	NC_019967	GTC	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
93	NC_019967	CGA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
94	NC_019967	CG	3	6	6531	6536	0 %	0 %	50 %	50 %	433593324
95	NC_019967	CGC	3	9	6569	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
96	NC_019967	AGC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
97	NC_019967	CCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
98	NC_019967	CGC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
99	NC_019967	AGCC	2	8	6710	6717	25 %	0 %	25 %	50 %	433593324
100	NC_019967	CGT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
101	NC_019967	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
102	NC_019967	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
103	NC_019967	TGA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593324
104	NC_019967	CGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
105	NC_019967	CGCGAC	2	12	6881	6892	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433593324
106	NC_019967	CG	3	6	6924	6929	0 %	0 %	50 %	50 %	433593324
107	NC_019967	AGG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
108	NC_019967	GCC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
109	NC_019967	GGA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
110	NC_019967	GCC	2	6	7017	7022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
111	NC_019967	GAC	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
112	NC_019967	GCC	2	6	7055	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
113	NC_019967	ATC	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
114	NC_019967	GTCC	2	8	7235	7242	0 %	25 %	25 %	50 %	433593324
115	NC_019967	CCAC	2	8	7318	7325	25 %	0 %	0 %	75 %	433593324
116	NC_019967	TCG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
117	NC_019967	CGA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
118	NC_019967	TTC	2	6	7454	7459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
119	NC_019967	GGT	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593324
120	NC_019967	TCGC	2	8	7494	7501	0 %	25 %	25 %	50 %	433593324
121	NC_019967	GTT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593324
122	NC_019967	AAG	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593325
123	NC_019967	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
124	NC_019967	GCT	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
125	NC_019967	GCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
126	NC_019967	TCG	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
127	NC_019967	CAG	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
128	NC_019967	CAA	2	6	8527	8532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593325
129	NC_019967	AGGC	2	8	8552	8559	25 %	0 %	50 %	25 %	433593325
130	NC_019967	CGAC	2	8	8576	8583	25 %	0 %	25 %	50 %	433593325
131	NC_019967	CGA	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
132	NC_019967	GAG	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593325
133	NC_019967	TCG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
134	NC_019967	GCG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593325
135	NC_019967	CG	3	6	8716	8721	0 %	0 %	50 %	50 %	433593325
136	NC_019967	CGA	2	6	8724	8729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593325
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154	NC_019967	GACATC	2	12	9260	9271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593326
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253	NC_019967	TGA	2	6	15329	15334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593333
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381	NC_019967	CGA	2	6	21633	21638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593340
382	NC_019967	GTCG	2	8	21654	21661	0 %	25 %	50 %	25 %	433593340
383	NC_019967	GA	3	6	21686	21691	50 %	0 %	50 %	0 %	433593340
384	NC_019967	AGATGT	2	12	21738	21749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593340
385	NC_019967	CCA	2	6	21884	21889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593340
386	NC_019967	CCG	2	6	22076	22081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593341
387	NC_019967	CA	3	6	22095	22100	50 %	0 %	0 %	50 %	433593341
388	NC_019967	CGA	3	9	22164	22172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593341
389	NC_019967	TGA	2	6	22193	22198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593341
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465	NC_019967	ACTGC	2	10	26338	26347	20 %	20 %	20 %	40 %	433593345
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497	NC_019967	CG	3	6	27487	27492	0 %	0 %	50 %	50 %	433593345
498	NC_019967	CAT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593345
499	NC_019967	GTG	2	6	27588	27593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593345
500	NC_019967	AGCGG	2	10	27628	27637	20 %	0 %	60 %	20 %	433593345

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